Az SH2 tartomány jellemzői, szerkezete és funkciói
az SH2 tartomány (Src Homológia 2) az evolúcióban nagymértékben konzervált és több mint 100 különböző fehérjében jelenlévő fehérje-domén, a legjelentősebb az oncoprotein src, amely részt vesz a sejten belüli jelátviteli folyamatban..
A domén funkciója a fehérjékben lévő foszforilált tirozin szekvenciákhoz való kötődés; ez az unió olyan jelek sorozatát indítja el, amelyek szabályozzák a gének expresszióját. Ezt a domént is megtalálta a tirozin-foszfatáz enzimben.
Általában SH2 doméneket találunk együtt más doménekkel, amelyek a jelátviteli útvonalakhoz kapcsolódnak. Az egyik leggyakoribb interakció az SH2 és SH3 tartományhoz való kapcsolódás, amely úgy tűnik, hogy részt vesz a prolin-gazdag szekvenciákkal való interakció szabályozásában.
A fehérjék egyetlen SH2 domént vagy többet is tartalmazhatnak, mint a GAP fehérje és a foszfoinozitol-3-kinázok p85 alegysége esetében..
Az SH2 domént széles körben tanulmányozták a gyógyszeripar annak érdekében, hogy gyógyszert állítson elő olyan betegségek elleni küzdelemben, mint a rák, az allergia, az autoimmun betegségek, az asztma, az AIDS, az osteoporosis..
index
- 1 Jellemzők
- 2 Szerkezet
- 3 Funkciók
- 4 Evolúció
- 5 Klinikai következmények
- 5.1 Az X-hez kapcsolódó limfoproliferatív anyag
- 5.2 Az X-kromoszómához kapcsolódó agammaglobulinémia
- 5.3 Noonan-szindróma
- 6 Referenciák
jellemzői
Az SH2 domén körülbelül 100 aminosavból áll, amelyek a katalitikus doménekhez kapcsolódnak. A legnyilvánvalóbb példa a tirozin-kináz enzimek, amelyek felelősek a foszfát-csoportnak az ATP-ről a tirozin aminosavmaradékokba történő átvitelének katalizálásáért..
Ezenkívül SH2 doméneket jelentettek olyan nem katalitikus doménekben, mint a crk, grb2 / sem5 és nck.
Az SH2 domének a magasabb eukariótákban vannak jelen, és azt javasoljuk, hogy az élesztőben is megjelennek. A baktériumok tekintetében Escherichia coli jelentették az SH2 tartományokra emlékeztető modult.
Az src-fehérje az első felfedezett tirozin-kináz, amely mutáció esetén valószínűleg részt vesz a kináz-aktivitás szabályozásában és ezen fehérjék kölcsönhatásának elősegítésében a sejten belüli más komponensekkel is..
Miután felfedezték a scr fehérjében lévő doméneket, az SH2 domént nagyszámú, igen változatos fehérjében azonosították, beleértve a protein tirozin kinázokat és a transzkripciós faktorokat..
struktúra
Az SH2 domén szerkezetét olyan technikák, mint a röntgendiffrakció, kristályosítás és NMR (nukleáris mágneses rezonancia) felhasználásával tártuk fel, közös mintákat találva a vizsgált SH2 domének másodlagos szerkezetében..
Az SH2 tartomány öt erősen konzervált motívummal rendelkezik. Egy általános domén a p-lapok közepétől áll, amelyek a szomszédos anti-párhuzamos β-lapokkal párhuzamosan két α-hélixet tartalmaznak..
A levél egyik oldalán és az AA terminális régióban lévő aminosavmaradékok részt vesznek a peptidek kötődésének összehangolásában. Azonban a fehérjék többi jellemzője a vizsgált domének között igen változatos.
A terminális szénrészben a harmadik helyen izoleucin-maradék található, és hidrofób zsebet képez az SH2 domén felületén..
Fontos jellemzője két régió létezése, amelyek mindegyike egy adott funkcióval rendelkezik. Az első α-hélix és a β-lap között elhelyezkedő zóna a foszfotirozin felismerő hely.
Továbbá, a p-lemez és a terminális szén a-hélixe közötti régió egy olyan területet képez, amely felelős a foszfotirozin terminális szénatomjával való kölcsönhatásért..
funkciók
Az SH2 domén funkciója az aminosav-tirozin aminosavak foszforilációs állapotának felismerése. Ez a jelenség döntő fontosságú a jelek transzdukciójában, amikor a sejt külső részén elhelyezkedő molekulát a membránban lévő receptor felismeri és feldolgozza a sejten belül..
A jelátvitel rendkívül fontos esemény a szabályozásban, amelyben a sejt válaszol az extracelluláris környezet változásaira. Ez a folyamat az egyes molekuláris hírvivőkben lévő külső jelek transzdukciójának köszönhető a membránján keresztül.
A tirozin-foszforiláció a fehérje-fehérje kölcsönhatások szekvenciális aktiválásához vezet, ami a génexpresszió vagy a megváltozott sejtválasz változását eredményezi..
Az SH2 domént tartalmazó fehérjék szerepet játszanak az alapvető sejtes folyamatokkal kapcsolatos szabályozási útvonalakban, mint például a citoszkeleton átrendeződése, homeosztázis, immunválaszok és fejlődés..
evolúció
Az SH2 domén jelenlétét a primitív egysejtű szervezetben jelentették Monosiga brevicollis. Úgy gondoljuk, hogy ez a domén invariáns jelzőegységként fejlődött ki a tirozin foszforiláció megjelenésével.
Feltételezhető, hogy a tartomány ősi elrendezése arra irányult, hogy a kinázokat a szubsztrátjaik felé irányítsa. Így az organizmusok összetettségének növekedésével az SH2 domének az evolúció során új funkciókat szereztek, mint például a kinázok katalitikus domén alloszterikus szabályozása..
Klinikai következmények
Az X-hez kapcsolódó limfoproliferatív anyag
Néhány mutált SH2 domént azonosítottak betegségként. Az SAP SH2 doménjének mutációi X-kapcsolt limfoproliferatív betegséget okoznak, ami nagyfokú érzékenységet okoz bizonyos vírusokra, és így a B-sejtek szabályozatlan proliferációja következik be.
A proliferáció azért keletkezik, mert az SH2 domének mutációja hibákat okoz a B és T sejtek közötti jelátviteli útvonalakban, ami vírusfertőzésekhez és B sejtek szabályozatlan növekedéséhez vezet..
Az X-kromoszómához kapcsolódó agammaglobulinémia
Hasonlóképpen, a Bruton protein kináz SH2 doménjének mutációi felelősek az agammaglobulinémia nevű állapotért.
Ez az állapot kapcsolódik az X kromoszómához, jellemzi a B-sejtek hiánya és az immunoglobulin-koncentrációk erős csökkenése.
Noonan-szindróma
Végül az SH2 domén N-terminális régiójában lévő mutációk a protein tirozin-foszfatáz 2-ben a Noonan-szindróma oka..
Ezt a patológiát elsősorban a szívbetegség, a rövid növekedés jellemzi a növekedési sebesség csökkenése és az arc- és a csontrendszeri rendellenességek miatt. Emellett a vizsgált esetek egynegyedében az állapot mentális és pszichomotoros retardációt okozhat.
referenciák
- Berg, J. M., Stryer, L. és Tymoczko, J. L. (2007). biokémia. Megfordultam.
- Filippakopoulos, P., Müller, S., és Knapp, S. (2009). SH2 domének: a nonreceptor tirozin kináz aktivitásának modulátorai. Jelenlegi vélemény a strukturális biológiában, 19(6), 643-649.
- Kurochkina, N. (szerk.). (2015). Sh tartományok: struktúra, mechanizmusok és alkalmazások. ugró.
- Sawyer, T. K. (1998). Src homológia-2 domének: Struktúra, mechanizmusok és gyógyszer-felfedezés. Peptid tudomány, 47(3), 243-261.
- Schlessinger, J. (1994). SH2 / SH3 jelző fehérjék. Jelenlegi vélemény a genetikában és a fejlődésben, 4(1), 25-30.